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Testung auf TRK-Fusionstumore

Obwohl NTRK-Genfusionen als eine der ersten genetischen Krebsursachen identifiziert wurden, wird bei Genom-Analysen nicht routinemäßig darauf getestet.[1][2]

Nur mit speziellen Tests kann man TRK-Fusionstumore entdecken[1][3]

 

Sensitive und spezifische diagnostische Tests für TRK-Fusionstumore
[4][5][6]

 

Next-Generation Sequencing (NGS, Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation) ist eine Testmethode zur Detektion einer großen Anzahl von Genveränderungen bei minimalem Gewebebedarf.[3][4]

 

Auswahl an kommerziell verfügbaren NGS-Panels für Illumina oder IonTorrent-Plattformen, mit denen alle 3 NTRK-Genfusionen nachweisbar sind*:

 

  • Foundation Medicine[a]
  • TruSight & AmpliSeq Panels[b] (für Illumina-Plattformen)
    z. B. TruSight Tumor 170, TruSight RNA Fusion, TruSight RNA Pan-Cancer Panel, AmpliSeq Focus Panel, AmpliSeq Comprehensive Panel v3.
  • FusionPlex Assays[c] (für Illumina und IonTorrrent-Plattformen)
    z. B. FusionPlex Solid Tumor Kit, FusionPlex CTL Kit, FusionPlex Oncology Research Kit, FusionPlex Lung Kit.
  • Oncomine Assays[d] (für IonTorrent-Plattformen)
    z.B. Oncomine Focus Assay, Oncomine Comprehensive Assay.

 

Auch Nachweise mittels Immunhistochemie (IHC) oder Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) wurden bereits erfolgreich eingesetzt. Dabei ermöglicht die Verfügbarkeit von Pan-TRK-Antikörpern einen indirekten Nachweis über die entsprechende Detektion der TRKA, B, C-Proteinexpression[7], während der Einsatz von FISH sich durch die begrenzten Fähigkeiten zum Multiplexeinsatz vor allem bei sehr gezielten Indikationslagen eignen könnte[3][4][5][8]

 

* derzeit nur für Forschungszwecke verfügbar.

 

PP-NEX-DE-0115-1

 

Weiter zu
TRK-Fusionstumor
    • 1
      Vaishnavi A et al. Cancer Discov. 2015;5(1):25-34.
    • 2
      Kumar-Sinha C et al. Genome Med. 2015;7:129. doi:10.1186/ s13073-015-0252-1.
    • 3
      Kumar-Sinha C et al. Genome Med. 2015;7:129. doi:10.1186/s13073-015-0252-1.
    • 4
      Abel HJ et al. J Mol Diagn. 2014;16(4):405-417.
    • 5
      Rogers T-M et al. Sci Rep. 2017;7:42259. doi:10.1038/srep42259.
    • 6
      Abel HJ, Duncavage EJ. Cancer Genet. 2013;206(12): 432-440.
    • 7
      Hechtman JF et al. Am J Surg Pathol. 2017;41(11):1547-1551.
    • 8
      Amatu A et al. ESMO Open. 2016;1(2):e000023.
    • a
      https://www.foundationmedicine.de/
    • b
      https://www.illumina.com/areas-of-interest/cancer/clinical-cancer-research/products.html
    • c
      http://archerdx.com/fusionplex-assays/
    • d
      https://www.thermofisher.com/de/de/home/clinical/preclinical-companion-diagnostic-development/oncomine-oncology.html